SHZD3201
基本信息
SHZD3201
转基因
大豆
上海交通大学
上海交通大学
2019年12月02日
耐除草剂
分子信息
左侧翼序列(3')
TGCCATCATCAATGGTCACACGGAGTGGGACTACAGAATTTGAAAATAGTAGAGAAAACAGCAGTGGGCACTTGCTATTTTCCTTTCATCATTGGAAATTAAATGGGGAAAGGGAAAAAAATATTTCTGTTTTCTACAATGAATGACAATAATAGGAGATTTGGTTTTCGTAGAATCAGAATTATTCAAAAAAAGAAAAACAGAATTCCATTGAACGAATTCCCTGCACTTTTGTTGATACTAAGGGTATATCTCTCTCTTGATATTGGGAGATTATTTCCTCCATAGAGTACAATTTTTTTTTTTTTTTACTTTTTTCAAGTTTCAACAAGTTTTTACAGTAAATACATAGAAATTTAATTATTTTCAAAATTGGATAAAACGCCTTCATTTATAGAGAATTTTCTCTCTCCCTGTGTATTTATTTCTTATAACTTGAAGCTTCTTTGGAATGCTGCTTTATCTTTTAAAACAGCTTGTTTTAAGGTTAACATTAACTAAATTCCCTATCATCTACTTACTTTGCCGGCCGACTAGTTATAAAAGAATTAGATGATTCATTGCCTCAACCTATTAGGGTTTTCCCGATGAAGGATTAAATTAGACATAATTAGGTGCATGAAGGCTTAAGTTTGATCTTCCTTATTATTATTGTATTAAAAAAAAAGCAAATTACACTAACTCTCTATGTTTAATACTTGTTACACTCAAAGTCACTCATTATTGGAACCCTACACATCCCCTTCCCCCTTCGCTGTTGCAACTCATTGCACAAAGACCCCCTAACCGTCTATTTCATTAACTTTAGGATGTTGCTAAGCACATGCATTTTAA
启动子 1 (CaMV35S启动子)
该启动子序列暂未录入
插入基因 (G10-epsps基因)
T-DNA序列：
CGAATTAATTCGGGGGATCTGGATTTTAGTACTGGATTTTGGTTTTAGGAATTAGAAATTTTATTGATAGAAGTATTTTACAAATACAAATACATACTAAGGGTTTCTTATATGCTCAACACATGAGCGAAACCCTATAGGAACCCTAATTCCCTTATCTGGGAACTACTCACACATTATTATGGAGAAACTCGAGCTCCTATAGGCGGTAGCCTCAGCGTATTCGAATCTAGCACCAAGAGCTTCAAGGTGAGCGAAGAACTGAGGGTAGGACTTTCTGATGTGGTGTGCACCGGTGATTCTAAGTGGAGCATCTGCTCTGAGACCAAGAAGGGTGAGAAGCATGATCATTCTGTGGTCACCGTGACCATCAGCGGTGATACCACCAGCAAGGTGAGCAGAACCAGTAACGGAGAGAGAATCGGCGGTCTCTCTTGCTCTAAGACCAAGTCTTTCAAGCTCAGCTCTGGTGTCAGAGATTCTATCGCATTCCTTGAGTCTAAGAGTAGCAACGTTTTCCCAGGTGGTATCACCCTCAGCGAAGGCAGCAGCAGCGGTAAGAGCTTGCACGGCGTCGGTGAAGGAATCACCATCTCTAGTAACAGCGTGGAGAGGTCTACCACCTCTCACGGTAAGGGTATCACCTTCTCTAACGATATCAGCACCCATCTCTCTAAGAACGTTCACAGCTTCCTTCTCACCCTGGAGGTCGTGTTCTCTAAGGTTAGAAAGTCTAACCTCACCTGGGAGAAGAGCAGCGGCGGTAAGGATAGCAGCGGAACCAGGGTAATCACCAGGAACGAGCACTCTACCTGGTCTGTACTTCTGACCACCAGGGATGGAGATTCTTCTAAGGTCATCGGAGGCAGTAGCTCTAACACCGAAATCAGAGAGGGTGTCAAGTGTCTGTCTAAGAGGAGCGTGGGACTTGATATCACCGGTGAGTCTAAGTTCGAGTCCGTCAGGAAGAAGAGGACCGAGGAACATAAGGGCGGAAGCGTACTGGGAGGATCTTTCGGCGGAAACCTCCACTGTACCACCTCTAACTGGACCGGAAACGGAGATAGGGAGTCTACCATCGTTGGAGGACACCCAAGCACCAAGTCTTTCGAGGGCTTCAAGAAGGTCACCCTGAGGTCTCTTACCAAGGGAATCAGGGTAATCGGTAACGAAAGTTGTACCAGAGGTGAGAGCAGCAACACCCATAAGGAGTCTGGCCACCGCAGCAGCGTTACCTGGGTTAAGGGTAACACCAGCCTGTGGTCTAGCACCGAAACCTCTGATCACGGCGTCATCACCAACAAGCTCAACACCAGCACCCCAATCTCTGAGGCATCTGAGCATAGCTTCGGCATCCTCAGAGGTAGCCACACCAACAACTCTGGTTTCACCCTCAGCGAGAGCAGCGGCGAGGAGGTATCTAGTGGTGTAGTTCTTGGATGGCTGTGCTCTAAGTTCACCTCTGAGTTCTCTAGCTGGATGCACGATAACGTCGAAGGTAGCTGGAAGAGCGTCGGATCCCTTCTCCGCCGTGGAAACAGAAGACATGACCTTAAGAGGACGAAGCTCAGAGCCAATTAAAGTCATCCCACTCTTCTTCAATCCCCAAGATGAAGAAATTGGATAAGCTCGTGGATGCTGCTGAGTCTTCAGAGAAACCGATAAGGGAGATTTCCTTTGACTGGATTTAGAGAGATTGGAGATAAGAGATGGGTTCTGCACACCATTGCAGATTCTGCTAACTTGAGCCATGGCTATCGTTCGTAAATGGTGAAAATTTTCAGAAAATTGCTTTTGCTTTAAAAGAAATGATTTAAATTGCTGCAATAGAAGTAGAATGCTTGATTGCTTGAGATTCGTTTGTTTTGTATATGTTGTGTTGACTCGAGAGAGATAGATTTGTAGAGAGAGACTGGTGATTTCAGCGTGTCCTCTCCAAATGAAATGAACTTCCTTATATAGAGGAAGGTCTTGCGAAGGATAGTGGGATTGTGCGTCATCCCTTACGTCAGTGGAGATATCACATCAATCCACTTGCTTTGAAGACGTGGTTGGAACGTCTTCTTTTTCCACGATGCTCCTCGTGGGTGGGGGTCCATCTTTGGGACCACTGTCGGCAGAGGCATCTTGAACGATAGCCTTTCCTTTATCGCAATGATGGCATTTGTAGGTGCCACCTTCCTTTTCTACTGTCCTTTTGATGAAGTGACAGATAGCTGGGCAATGGAATCCGAGGAGGTTTCCCGATATTACCCTTTGTTGAAAAGTCTCAATAGCCCTTTGGTCTTCTGAGACTGTATCTTTGATATTCTTGGAGTAGACGAGAGTGTCGTGCTCCACCATGTTATCACATCAATCCACTTGCTTTGAAGACGTGGTTGGAACGTCTTCTTTTTCCACGATGCTCCTCGTGGGTGGGGGTCCATCTTTGGGACCACTGTCGGCAGAGGCATCTTGAACGATAGCCTTTCCTTTATCGCAATGATGGCATTTGTAGGTGCCACCTTCCTTTTCTACTGTCCTTTTGATGAAGTGACAGATAGCTGGGCAATGGAATCCGAGGAGGTTTCCCGATATTACCCTTTGTTGAAAAGTCTCAATAGCCCTTTGGTCTTCTGAGACTGTATCTTTGATATTCTTGGAGTAGACGAGAGTGTCGTGCTCCACCATGTTGGCAAGCTGCTCTAGCCAATACGCAAACCGCCTCTCCCCGCGCGTTGGCCGATTCATTAATGCAGCTGGCACGACAGGTTTCCCGACTGGAAAGCGGGCAGTGAGCGCAACGCAATTAATGTGAGTTAGCTCACTCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGACCATGATTACGAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGGCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGATCGCCCTTCCCAACAGTTGCGCAGCCTGAATGGCGAATGCTAGAGCAGCTTGAGCTTGGATCAGATTGTCGTTTCCCGCC
终止子 1 (CaMV35S终止子)
该终止子序列暂未录入
右侧翼序列(5')
ATAAGGGTGTATACTATAGTTAGTTGTATATGGCTAGTACTATGGCGGCGGTTCCGACCACCACGAGACCGTAGTACAACATGGGCATGCTGTTGCTCTTGGTTGATGGAGAGGAGGGTGGAGGAGGGGATGAGATGGTGAAGGGGCTTAGAACATCACCCATGATGGTTATAATTTAGTGTTTTGGTGAAATTCGAAGAGAGAACACAAGTTTTGAAGAAAGTTCTTTTGTAGACAACTAACTATAGTATACACCCTTATGGCCTTATCTATTCAATGAGGGTTATAATTTAGATGATGGAATTATTGGAGGGGGTTTATTGATTTATTTTTATTGAAAATATTAAATTAATGTTAAGTAGTTAAGCTAAAAGCCGTGGTGGTTATGTTATCATTGAAGGGGAGAATATAATTATTTTTTGCTCAAGTTGGATATAATATGTCATGGAATATTTACTATTTTAGAGAAGACTAAGAGGAGCAGACAAAGAAATGTACTATAAAGGGGGCAGTGAACAAAGATGGGTGAGAGTGACCAGAATTTTGTAGATAAGTGTCCTGTGTCCCTTGCACGTTCTATTTCTTTCTTTGCCTGGGGTTTTGGGAAGCCCCTATGGTTAAATGCTAAAAAACAATTTTTTGTATCTATTCGGAAATCAAATTTGCTTCTATTCATCACAGGTAAAGAGACATGTGATTTACTAAGATGTCATTCATAAATCC
检测信息
检测标靶：CaMV35S启动子
- 普通PCR
- 实时荧光PCR/数字PCR
引物序列
35SF: GCTCCTACAAATGCCATCATTGC ; 35SR: GATAGTGGGATTGTGCGTCATCCC
无
195bp
引物和探针序列
F: CGACAGTGGTCCCAAAGA; R: AAGACGTGGTTGGAACGTCTTC; P: TGGACCCCCACCCACGAGGAGCATC
/
/
74bp
- 普通PCR
- 实时荧光PCR/数字PCR
引物序列
F3:CTCCTCGGATTCCATTGC; B3: GTCTTGCGAAGGATAGTGG; FIP: GGCAGAGGCATCTTCAACGAGGAAGGTGGCTCCTACAA; BIP: CACGAGGAGCATCGTGGAAACGTCAGTGGAGATGGAGATATCACATCFLP:TTTCCTTTATCGCAATGATGGCBLP:AGAAGACGTTCCAACCACG
0.5%
269bp
引物和探针序列
/
/
0bp
- 普通PCR
- 实时荧光PCR/数字PCR
引物序列
无
bp
引物和探针序列
F:GCCTCTGCCGACAGTGGT ; R: AAGACGTGGTTGGAACGTCTTC ; P: CAAAGATGGACCCCCACCCACG
0.01%
/
82bp
- 普通PCR
- 实时荧光PCR/数字PCR
引物序列
无
bp
引物和探针序列
F：TTCCAACCACGTCTTCAAAGC； R：GGAAGGGTCTTGCGAAGGATA； P：CCACTGACGTAAGGGATGACGCACAATCC
0.1%
/
95bp
- 普通PCR
- 实时荧光PCR/数字PCR
引物序列
35SF:GCTCCTACAAATGCCATCATTGC; 35SR:GATAGTGGGATTGTGCGTCATCCC
0.1%
195 bp
引物和探针序列
F:CGACAGTGGTCCCAAAGA; R:AAGACGTGGTTGGAACGTCTTC; P：TGGACCCCCACCCACGAGGAGCATC
0.1%
/
74bp
检测标靶：CaMV35S终止子
- 普通PCR
- 实时荧光PCR/数字PCR
引物序列
T35S-F1: GTTTCGCTCATGTGTTGAGC; T35S-R1: GGGGATCTGGATTTTAGTACTG
无
121bp
引物和探针序列
T35S-QF: GTTTCGCTCATGTGTTGAGC; T35S-QR: GGGGATCTGGATTTTAGTACTG; T35S-QP: GAAACCCTTAGTATGTATTTGTATTTG
/
/
121bp
- 普通PCR
- 实时荧光PCR/数字PCR
引物序列
无
bp
引物和探针序列
T35S-QF：TCACCAGTCTCTCTCTACAAATCTATC； T35S-QR：CAACACATGAGCGAAACCCTATAA； T35S-QP：TGTGTGAGTAGTTCCCAGATAAGGGAATTAGGGT
0.1%
/
101bp
- 普通PCR
- 实时荧光PCR/数字PCR
引物序列
无
bp
引物和探针序列
F: GGGGTTTCTTATATGCTCAACACATG; R: TCACCAGTCTCTCTCTACAAATCTATCAC; P: ACCCTATAAGACCTATTCCCTTATCTGGGA
0.01%
/
118bp
检测标靶：转化体
- 普通PCR
- 实时荧光PCR/数字PCR
引物序列
SHZD3201F:GAGCAGCTTGAGCTTGGA; SHZD3201R: CGAATTTCACCAAAACACTAA
0.1%
234bp
引物和探针序列
SHZD3201QF: TCGTTTCCCGCCATAAGG ; SHZD3201QR: CATCAACCAAGAGCAACAGCAT; SHZD3201P: TCCGACCACCACGAGACCGTAGTACA
0.05%
/
120bp